新《认定办法》的特点是以企业自主研发和创新能力为核心来认定高新技术企业。按照新《认定办法》的规定，高新技术企业应该是在国家重点支持的高新技术领域内，持续进行研究开发与技术成果转化，形成企业核心自主知识产权，并以此为基础开展生产经营活动，在中国境内（不包括港、澳、台地区）注册满365个日历天数的居民企业。符合以上特征并达到相应认定指标的企业才能被认定为高新技术企业。没有开展研究开发活动，单纯从事高新技术产品生产加工的企业，不能被认定为高新技术企业。

知识产权
    高新技术企业认定所指的知识产权须在中国境内授权或审批审定，并在中国法律的有效保护期内。知识产权权属人应为申请企业。
核心自主知识产权
    《认定办法》规定的知识产权分为以下两类，评价方式采用分类评价。其中：发明（含国防）、植物新品种、农作物品种、国家新药、国家一级中药保护品种、集成电路布图设计专有权等按Ⅰ类评价；实用新型外观设计软件著作权等（不含商标）按Ⅱ类评价。
核心自主知识产权的来源
    企业通过自主研发、受让、受赠、并购等方式。相比旧办法，新办法已经取消了采用通过5年以上的独占许可方式获得的知识产权在高新认定评审中的作用。
公司有效知识产权
    在申请高新技术企业认定之前获得且证书在有效期内的知识产权，或者申请之前未获得证书但是已经获得授权通知书并能提供缴费收据的知识产权均可算有效的知识产权。但新的工作指引明确提出，实用新型外观设计、软件著作权等（不含商标）等按Ⅱ类评价的知识产权在申请高新技术企业时，限使用一次；之前用于申报过国家高新技术企业认定但是申报未通过，和用于申报过深圳市高新技术企业的知识产权还能继续使用。
学历要求
    新的管理办没有限定科技人员的学历，但在评审时可能会考虑科技人员的工作岗位。
科技成果转化条件
    从目前申报系统的填写规则来看，体现科技成果转化的研发项目必须要有相关的知识产权作为支撑。
成果转化的数量计算
    如果公司多个研发项目转化成了一种产品则可以算多个成果转化，但同一科技成果分别在国内外转化的，或转化为多个产品、服务、工艺、样品、样机等的，只计为一项。
每年成果转化数量相关要求
    指引中提到科技成果转化根据年平均数进行评分，如一个公司在科技成果转化上想拿到较高的分数，则三年内成果转化总数达到15项。
公司发生名称变更
    名称变更根据变更范围分两种：1、简单变更：仅企业名称发生变更；2、复杂变更：经营范围变更以及经营业务、生产技术活动发生重大变化。对于两种名称变更，在操作上有较大区别，企业可在深圳科技创新委网站上查看今年名称变更的通知，按照通知要求完成更名。